De siste årene er det satt i verk en rekke tiltak for å begrense tilførslene av forurensninger til Grenlandsfjordene. I dag er de direkte utslippene fra industrien og kommunene kraftig redusert. Resultatene fra undersøkelser Norsk institutt for vannforskning (NIVA) har foretatt av det biologiske mangfoldet på sjøbunnen er samlet i rapporten "Overvåking i Grenlandsfjordene: Organismesamfunn på hardbunn 1998-99".

Resultatene er sammenlignet med tidligere undersøkelser utført siden 1974. Bedringen i miljøtilstanden i de siste undersøkelsene settes i sammenheng med de reduserte tilførsler av forurensende stoffer til fjordsystemet. Nedre voksegrense for fastsittende alger (det største dyp en finner alger på), og forholdet i antall arter mellom algeklassene rød-, brun- og grønnalger er positiv. Det ser også ut som om mangfoldet av fastsittende dyr har økt.

Undersøkelsene er en del av langtidsprogrammet 1996-2000 for overvåkingen av Grenlandsfjordene. Programmet omfatter også undersøkelser av miljøgifter i organismer og sedimenter, samt registrering av vannkvalitet og vannutskiftning. Overvåkingen inngår i Statlig program for forurensningsovervåking, som administreres av SFT.