På bakgrunn av forhøyede verdier av miljøgifter som PCB og til dels PAH, er det fastsatt kostholdsråd på konsum av lever fra fisk i Arendals havneområder.

Sjøbunnen har vist seg å være meget sterkt forurenset i bynære områder. I forbindelse med at den kommunale havna flyttet til et nytt område i Tromøysund ved Eydehavn i 2008, er risikoen for oppvirvling av forurenset sjøbunn som følge av skipstrafikk til bykjernen redusert. Tildekking av forurensede sedimenter utenfor det nye havneområdet har vært et av tiltakene for å forbedre forurensningssituasjonen der.

I de bynære sjøområdene er likevel forurensningssituasjonen slik at det er behov for å gjøre tiltak enkelte steder, bla. i Kittelsbukt. Også i forbindelse med eventuelle utbygginger innenfor havneområdene, vil det være nødvendig med flere oppryddingstiltak. For eksempel planlegges utbygging i deler av Kittelsbukt og utenfor Barbu (dypvannskai).

Kommunen har gjennomført undersøkelser i Barbubukta, Kittelsbukt og Bukkevika i Eydehavn og fått utarbeidet en plan for tiltak i Bukkevika i Eydehavn og Kittelsbukt. Kommunen har også fått tillatelse til å gjennomføre tiltak mot utlekking fra Tromøysundtippen i kombinasjon med tildekking av sjøbunnen i Bukkevika.

Fylkesmannens arbeid med å kartlegge aktive kilder til PCB-forurensning fra byen har ikke gjort at det kan utpekes noen spesiell forurensningskilde, men det bør utvises forsiktighet ved sanering av bygg og fasadeoppussing av bygg som kan inneholde PCB for å forhindre eventuelle utslipp fra disse arbeidene. Ny utført kostholdsrådundersøkelse i fjorden ble rapportert i 2008. Mattilsynet vurderte i 2009 at kostholdsrådet må opprettholdes.

Arendal havn. Kart: Klima- og forurensningsdirektoratet. (Klikk på bildet for stor versjon.)